 אגף תקציבים פועל כיחידה מקצועית ומרכזית בתוך משרד האוצר והוא אחראי על קביעת המדיניות הכלכלית של הממשלה. בין תפקידיו העיקריים: הכנת תקציב המדינה והגשתו לאישור הממשלה וכן גיבוש המדיניות המאקרו-כלכלית של הממשלה והגשתה לאישור מקבלי ההחלטות.
|  אגף החשב הכללי במשרד האוצר אחראי על ביצוע תקציב המדינה, ניהול שוטף של נכסי המדינה והתחייבויותיה, מימון הגירעון וניהול החוב הממשלתי. בנוסף אחראי האגף על ניהול צי הרכב הממשלתי ועל הרכש הממשלתי המרכזי.
אגף החשב הכללי פועל באמצעות עשר חטיבות שבראש כל אחת מהן עומד סגן בכיר לחשב הכללי הכפוף באופן ישיר לחשב הכללי, וכן באמצעות החשבים במשרדי הממשלה הכפופים מנהלית ומקצועית לחשב הכללי ומהווים את נציגיו במשרדי הממשלה השונים.
|
| . |
אגף שוק ההון, ביטוח וחיסכון אחראי על עסקי הביטוח הנעשים הארץ. בין פעולותיו השונות ניתן למנות רישוי חברות, פיקוח יציבותי על חברות הביטוח, קופות הגמל וקרנות הפנסיה ופיקוח על המוצרים המשווקים לציבור (פוליסות הביטוח, קרנות הפנסיה וקופות הגמל). בנוסף, האגף אחראי על קביעת מדיניות עידוד החיסכון והתאמתו לצרכי המשק הלאומי וטעמי הפרטים וזאת באמצעות ההסדרה והפיקוח על תכניות החיסכון, קופות הגמל, קרנות הפנסיה וקופות הביטוח | 
אגף השכר אחראי על קביעת מדיניות השכר ויישומה במגזר הציבורי, ניהול מו"מ בשם הממשלה בכלל המגזר הציבורי והמשק, פיקוח ובקרה על גופים ציבוריים (סעיף 29 לחוק יסודות התקציב), ישום תיקון 16 לחוק יסודות התקציב (כולל הפעלת יחידת האכיפה) וייעוץ לממשלה ולכנסת בנושאים הנוגעים לשכר. | | . |
רשות המסים בישראל הוקמה בשנת 2004 והיא מאחדת את אגף מס הכנסה ומסוי מקרקעין, אגף המכס והמע"מ ושירות העיבודים הממוכנים (שע"ם). הרשות אחראית על ייעול מערכת המס ושיפור השירות לציבור, ומהווה גם חלק בלתי נפרד ממערכת אכיפת החוק בישראל. |  רשות החברות הממשלתיות היא יחידת סמך של משרד האוצר, ואחראית מתוקף חוק החברות הממשלתיות והתקנות שתוקנו מכוחו על חברות בהן מחזיקה המדינה מניות. הרשות אחראית על כ-100 חברות, חלקן בבעלות ממשלתית (חברת החשמל, התעשייה האווירית, רכבת ישראל...) וחלקן בבעלות מעורבת (אגרקסקו, קרן קיסריה...). הרשות מייעצת לחברות עצמן, לועדות שרים ולמשרדי הממשלה על ניהול עסקי החברות, מפקחת על פעילותן השוטפת ועל יישום המלצות מבקר המדינה בנוגע אליהן ופועלת לביצוע שינויים מבניים, הפרטות ופירוקים על פי החלטות ממשלה ועוד. רפרנטים של הרשות משתתפים בישיבות הדירקטוריון של החברות כמשקיפים. | | . |
המחלקה לקשרים בינלאומיים מרכזת את מגעי משרד האוצר עם ממשלות זרות, ארגונים בינלאומיים וגופים כלכליים שונים - בתיאום עם משרד החוץ ועם יתר המשרדים הכלכליים. | 
מינהל הכנסות המדינה הוא יחידת מטה, העוסקת בגיבוש מדיניות המיסים של הממשלה, ובכלל זה גם רפורמות במערכת המיסים. המינהל מכין תחזית הכנסות שנתית לתקציב המדינה, ניתוח נתוני הגביה ומשמעותם הכלכלית, ניתוח השפעות חקיקה ומחקרים. המינהל מרכז את הטיפול בהצעות חקיקה ובקשרים בינלאומיים בתחום המיסוי וכן מנהל את הטיפול באמנות למניעת כפל מיסים. המינהל מפיק דוח שנתי מקיף המסכם ומנתח את נתוני השנה וכולל מחקרים נבחרים. בנוסף מפעיל המינהל את המוזיאון למיסים ומפרסם את הרבעון הישראלי למיסים. | | . |
אגף כלכלה ומחקר מרכז ומעבד מידע על התפתחויות כלכליות בארץ ובעולם, ומעריך את כיווני ההתפתחות העתידיים של המשק הישראלי. ההערכות משמשות בסיס להצעות למדיניות כלכלית, ומביאות בחשבון את יעדי המשק. האגף אחראי לייצוג משרד האוצר במוסדות ציבור, בארגונים שונים ובפני אמצעי תקשורת מהארץ ומחו"ל. בנוסף מייעץ האגף ותומך ביחידות אחרות במשרד האוצר בנושאי שכר, מחירים, מיסים, תקציב, תעסוקה ואבטלה, רווחיות, מאזן תשלומים, חובות מט"ח ועוד. | 
הרשות לזכויות ניצולי השואה ממונה על ביצוע חוק נכי רדיפות הנאצים וחוק נכי המלחמה
בנאצים. הרשות מעניקה תגמולים חודשיים, טיפול רפואי ושירותי שיקום ורווחה לציבור ניצולי השואה נכי רדיפות הנאצים ולנכי המלחמה בנאצים, על מנת לאפשר להם לחיות ברווחה יחסית.
כמו כן ממונה הרשות על ביצוע חוק ההטבות לניצולי שואה תשס"ז-2007, במסגרתו זכאים ניצולי השואה למענקים כספיים ולהטבות שונות.
למידע על מיצוי זכויותיהם של ניצולי השואה קיימים בלשכה שלושה מרכזי מידע בתל-אביב,ירושלים וחיפה וכן צוות מרכז מידע נייד המגיע אחת לחודש אל כ-10 ישובים בפריפריה, וזאת בנוסף לפרסומים החודשיים בתלוש התגמול ובמידע הנמסר על ידינו בכנסים מקומיים בערים השונות.
| | . |
 המדפיס הממשלתי הינו יחידת סמך במשרד האוצר.
תפקידו העיקרי של המדפיס הממשלתי הינו ביצוע והפקת עבודות הדפוס עבור משרדי הממשלה ויחידות הסמך באמצעות ייצור עצמי בבית הדפוס של המדפיס הממשלתי ו/או באמצעות התקשרויות עם קבלני משנה חיצוניים.
בין היתר, אחראי המדפיס הממשלתי על הדפסת תעודות הזהות והדרכונים, בחינות הבגרות, דו"חות ממשלתיים מסווגים, בולים,
הצעות חוק, רשומות ותקנות, חוזרים למיניהם, מעטפות וחומרים נלווים לבחירות הארציות והמקומיות ועוד.
המדפיס הממשלתי פועל כגוף עסקי שאינו מתוקצב, הוצאותיו מכוסות ע"י ההכנסות ממשרדי הממשלה ויחידות הסמך אותן הוא גובה בגין מתן השרות וביצוע העבודות.
|  מטה התקשוב הממשלתי אחראי על התווית אסטרטגיה ומדיניות טכנולוגיות המידע והשירות של המגזר הממשלתי בשיתוף גופים ציבוריים ובקרתם,
ניהול והובלת גוף הביצוע הממשלתי לפרויקטים ומערכים רוחביים, ולייעץ לממשלה בנושאים הקשורים לטכנולוגיות המידע.
|
